缴纳附加税会计分录的具体操作会因国家和地区的法律、税收政策不同而有所差异，以下是一个基本的会计分录操作流程：

假设某公司需要缴纳增值税附加税，以中国为例，增值税附加税属于一种“其他税收”，需要单独核算，计入损益表中。

1.记录应缴纳的增值税附加税金额：

借：其他应付款

贷：增值税附加税应交税款

2.实际缴纳增值税附加税时的会计分录：

借：增值税附加税应交税款

贷：银行存款

3.确认增值税附加税已经缴纳并核销应付款：

借：增值税附加税应交税款

贷：其他应付款

缴纳附加税的会计分录依据主要包括两个方面：

1.国家和地区的税收法规和规定：缴纳附加税是根据当地的税收法规和政策来确定的，例如在中国，增值税附加税的缴纳标准和方式由国家税务总局规定，公司需要按照相关规定进行会计分录操作。

2.会计准则：根据会计准则的规定，缴纳附加税应该如何进行会计分录，例如在中国，按照《企业会计准则》的规定，增值税附加税属于“其他税收”，需要单独核算，记入损益表中。

缴纳附加税的会计分录有以下作用：

1、记录财务流水：会计分录能够记录公司的财务流水，准确反映公司在一定时间内的资金进出情况。通过缴纳附加税的会计分录，公司能够记录缴纳的税款和实际支出的金额，从而了解财务状况。

2、完成纳税义务：缴纳附加税是企业必须履行的法定义务之一。通过会计分录的记录，可以确保公司及时、准确地履行纳税义务，避免违反税收法规和产生罚款等后果。

3、规范会计核算：会计分录是会计核算的基础，对于附加税的缴纳，规范的会计分录能够帮助公司保持财务记录的准确性和完整性，保证会计信息的真实性和可靠性。

4、提供财务信息：会计分录的记录是公司财务信息的重要来源之一，能够为公司管理层和投资人提供有价值的财务信息，包括税收负担、成本结构和经营状况等，有助于管理层制定决策和投资人做出投资决策。

综上所述，缴纳附加税的会计分录对于公司的财务管理和税务管理具有重要作用，是公司财务管理的必要环节。